唾液腺肿瘤（Salivary gland tumors, SGT）是发生在头颈部的罕见肿瘤，其亚型之间的异质性为临床诊断和治疗带来了极大困扰。

本研究构建了包含6种SGT亚型癌旁来源的类器官（SGT PDO）。通过组织学以及RNA测序，发现SGT PDO保留了亲代肿瘤亚型的异质性和转录特征；通过qPCR以及组织微阵列免疫组化染色（Tissue microarray, TMA），确认PTP4A1是粘液表皮样癌（Mucoepidermoid carcinoma, MEC）的生物标志物。总之，本研究为发现潜在的MEC生物标志物以及进一步了解和探索SGT的特征提供了具有参考意义的平台。

2.1 唾液腺肿瘤类器官保留亲本肿瘤的形态与转录组特征

研究团队构建了61例 SGT PDO，基于H&E和IHC染色，发现其细胞特征、形态与相应亚型肿瘤相似，且具有瘤间异质性。随后通过RNA测序和亚型一致性聚类分析，验证各亚型SGT PDO保留了相应亲本肿瘤的基因组特征，且不同亚型之间会有基质和上皮细胞重叠。

△ SGT PDO概括了亲本SGT的组织学和转录组特征

2.2 筛选并验证MEC亚型唾液腺肿瘤类器官的生物标志物

研究团队对比6种不同SGT亚型PDO及其相应亲本肿瘤的基因和转录组数据，发现SGT PDO中的生物标志物显示出与相应亚型肿瘤组织相似的表达模型。随后，研究人员聚焦在临床常见的MEC亚型，并将其与其他亚型的SGT PDO相比，发现NEFL和PTP4A1基因在MEC中高表达。随后通过qPCR和TMA染色，发现NEFL在MEC和其他亚型中均高表达，表明该基因不具备生物标志物的潜力；同时，PTP4A1在MEC中高表达，且表达水平相较于其他亚型显著升高。因此，研究团队确定了PTP4A1作为MEC的生物标志物以辅助病理诊断。

△ MEC亚型潜在生物标志物的筛选与验证

该研究团队首次建立了一个包含多个SGT亚型的PDO生物库，并验证PDO概括了相应亲本肿瘤的形态学和转录特征。借助SDT PDO模型，研究团队还发现了潜在的生物标志物PTP4A1。总之，该唾液腺肿瘤类器官生物库为发现潜在的生物标志物及进一步了解罕见肿瘤的特征提供了有参考意义的平台。

● 建立首个多亚型唾液腺肿瘤类器官生物库：各亚型的唾液腺肿瘤类器官重现了亲本肿瘤的形态学和转录组特征。

● 发现MEC亚型的特异性生物标志物：通过差异基因分析筛选出潜在的生物标志物，为研究和诊断罕见肿瘤提供了新的参考。

参考文献：

Wang B, Gan J, Liu Z, et al. An organoid library of salivary gland tumors reveals subtype-specific characteristics and biomarkers.J Exp Clin Cancer Res. 2022;41（1）:350. Published 2022 Dec 17. doi:10.1186/s13046-022-02561-5